35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1829 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  76.13 
 
 		 159 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  82.47 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  62.91 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  63.58 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  62.25 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  60.26 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  35.17 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  36.76 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  31.3 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  32.82 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  31.65 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  24.24 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  25.87 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  29.73 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  25.93 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  31.4 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  29.01 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  30.08 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  29.27 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  30.63 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  25.51 
 
 		 154 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>