More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0327 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
323 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  44.21 
 
 
327 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.79 
 
 
326 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000459206  normal  0.0486689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0461  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  40 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1754  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.45 
 
 
320 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0400991  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.35 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.51 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.51 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.89 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.35 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.21 
 
 
325 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  38.21 
 
 
325 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.21 
 
 
325 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.78 
 
 
329 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.21 
 
 
325 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.91 
 
 
325 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.93 
 
 
329 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.06 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.61 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.8 
 
 
328 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.91 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.98 
 
 
325 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.09 
 
 
447 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.53 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0396  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.91 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0339145  hitchhiker  0.0000324957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.28 
 
 
447 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.42 
 
 
448 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
321 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.78 
 
 
325 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.37 
 
 
326 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.28 
 
 
320 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.13 
 
 
320 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.71 
 
 
441 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.05 
 
 
321 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.67 
 
 
327 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40 
 
 
441 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.23 
 
 
443 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.42 
 
 
329 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.5 
 
 
316 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.81 
 
 
317 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  37.5 
 
 
320 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.83 
 
 
452 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.82 
 
 
452 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.91 
 
 
315 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.55 
 
 
436 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.12 
 
 
399 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.73 
 
 
321 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.37 
 
 
317 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.61 
 
 
330 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.39 
 
 
317 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.73 
 
 
317 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.62 
 
 
325 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.91 
 
 
313 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.58 
 
 
315 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.96 
 
 
316 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1241  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.93 
 
 
324 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0280664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  39.69 
 
 
321 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  35.91 
 
 
321 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.32 
 
 
317 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.07 
 
 
318 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.13 
 
 
350 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.03 
 
 
443 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.11 
 
 
309 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.94 
 
 
335 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.94 
 
 
335 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.93 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.6 
 
 
308 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.37 
 
 
320 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.5 
 
 
321 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.84 
 
 
338 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.08 
 
 
334 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.33 
 
 
339 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.07 
 
 
308 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.3 
 
 
308 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.3 
 
 
308 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.02 
 
 
345 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  32.73 
 
 
346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.3 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.6 
 
 
320 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.92 
 
 
339 aa  153  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.2 
 
 
321 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.63 
 
 
320 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.46 
 
 
309 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.33 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  35.06 
 
 
318 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.07 
 
 
308 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.02 
 
 
346 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.73 
 
 
307 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.55 
 
 
308 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1526  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.92 
 
 
295 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  35.26 
 
 
341 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.38 
 
 
322 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.19 
 
 
323 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.79 
 
 
308 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
307 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.14 
 
 
325 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.04 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.6 
 
 
307 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>