60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0253 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  66.27 
 
 		 191 aa  241  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  59.77 
 
 		 180 aa  215  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  55.43 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  41.95 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  42.44 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  41.28 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  41.92 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  41.32 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  40 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  39.88 
 
 		 198 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  38.73 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  38.73 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  38.73 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  38.73 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  41.32 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  40.24 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  39.41 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  39.53 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  41.62 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  38.37 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  36.63 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  37.71 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  39.18 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  36.52 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  38.29 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  36.63 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  40.24 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  38.51 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  39.66 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  37.21 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  35.96 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  38.46 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  36.26 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  36.57 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  36.42 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  38.86 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  36.42 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  32.94 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  36.31 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  32.4 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1324  hypothetical protein  34.29 
 
 		 178 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  34.48 
 
 		 192 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  34.09 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2691  hypothetical protein  29.78 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000254  hypothetical protein  31.36 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  31.28 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  29.65 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0072  hypothetical protein  23.5 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>