62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4350 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  53.57 
 
 
199 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  50.56 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  54.02 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  52.02 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  52.02 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  52.02 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  52.02 
 
 
200 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  51.74 
 
 
197 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  51.45 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  51.45 
 
 
200 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  51.74 
 
 
197 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  51.74 
 
 
197 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  51.43 
 
 
194 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  45 
 
 
183 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  51.45 
 
 
197 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  51.14 
 
 
193 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  50.87 
 
 
200 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  50.58 
 
 
193 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  49.41 
 
 
173 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  47.16 
 
 
183 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  42.86 
 
 
187 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  42.29 
 
 
187 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  43.45 
 
 
185 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  45.76 
 
 
184 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  47.22 
 
 
185 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  39.53 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  45.09 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  44.12 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  43.09 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  43.35 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  44.12 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  40.8 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  47.67 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  37.79 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  36.63 
 
 
177 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  38.15 
 
 
177 aa  117  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  37.57 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  37.64 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  38.15 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1324  hypothetical protein  39.31 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  36.26 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  31.82 
 
 
184 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  37.43 
 
 
194 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  30.23 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000254  hypothetical protein  41.96 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  32.58 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  34.12 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  36.47 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  33.33 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  36.51 
 
 
192 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  37.16 
 
 
209 aa  90.9  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2691  hypothetical protein  32.16 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  30.06 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  32.2 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  31.64 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0072  hypothetical protein  31.15 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  30.06 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  28.67 
 
 
750 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0986  hypothetical protein  26.99 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>