57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1062 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  63.48 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  35.63 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  35.63 
 
 
177 aa  114  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  31.87 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  33.33 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  30.56 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  34.81 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  34.86 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  29.59 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  30.6 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  27.43 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  29.65 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  28.73 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  30.17 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  26.9 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  35.96 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  32.42 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  26.67 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  32.57 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  28.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  28.57 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  30.43 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  29.61 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  33.14 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  30.48 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  29.65 
 
 
175 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  26.97 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  29.61 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  31.64 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  28.65 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  28.81 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  32.58 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  26.88 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  28.81 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  28.81 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  24.28 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  28.41 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  30.29 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  30.06 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  28.9 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  28.07 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  22.7 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  30.94 
 
 
181 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  31.69 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  26.74 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  31.98 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  27.38 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  25.56 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16400  hypothetical protein  32.56 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>