60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3190 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  60.12 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  58.24 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  56.98 
 
 		 200 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  52.02 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  56.4 
 
 		 197 aa  198  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  55.81 
 
 		 200 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  57.06 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  56.14 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  55.29 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  53.22 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  52.94 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  52.6 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  56.98 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  56.98 
 
 		 197 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  56.98 
 
 		 197 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  56.98 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  56.98 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  55.81 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  54.82 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  56.4 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  49.71 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  49.41 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  44.91 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  44.91 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  41.04 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  37.35 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  38.92 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  36.63 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  40.12 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  37.72 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  39.08 
 
 		 209 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  38.95 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  36.53 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  33.14 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  35.54 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  36.05 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  29.89 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  32.53 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  34.13 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  32.34 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1324  hypothetical protein  34.86 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  35.33 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  32.75 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000254  hypothetical protein  41.28 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  32.37 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2691  hypothetical protein  30.39 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  32.95 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  28.99 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  28.4 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  26.04 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0072  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>