60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1780 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  100 
 
 
197 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  98.48 
 
 
197 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  82.32 
 
 
198 aa  314  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  89.67 
 
 
193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  89.13 
 
 
193 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  85.2 
 
 
194 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  73.6 
 
 
200 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  73.1 
 
 
200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  73.1 
 
 
200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  72.59 
 
 
200 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  72.59 
 
 
200 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  72.59 
 
 
200 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  72.59 
 
 
200 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  70.56 
 
 
197 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  64.12 
 
 
181 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  61.49 
 
 
185 aa  227  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  59.2 
 
 
183 aa  224  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  63.01 
 
 
184 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  57.07 
 
 
199 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  59.43 
 
 
181 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  58.86 
 
 
181 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  56.98 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  53.76 
 
 
185 aa  194  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  56.5 
 
 
180 aa  194  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  55.75 
 
 
184 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  51.74 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  51.46 
 
 
183 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  52.27 
 
 
175 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  45.4 
 
 
184 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  47.37 
 
 
177 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  44.38 
 
 
191 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  45.93 
 
 
180 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  148  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  42.69 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  39.2 
 
 
187 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  39.08 
 
 
187 aa  140  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  38.73 
 
 
177 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  40 
 
 
208 aa  137  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  42.05 
 
 
181 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  42.05 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  41.24 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  42.35 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  36.78 
 
 
194 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  34.3 
 
 
184 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  41.52 
 
 
183 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1324  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  37.29 
 
 
209 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  38.1 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  31.4 
 
 
189 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2691  hypothetical protein  35.16 
 
 
178 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  35.43 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  34.88 
 
 
192 aa  92  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  32.77 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  32.77 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000254  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  29.05 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  25.7 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0072  hypothetical protein  24.59 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>