60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1919 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1919  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0570  hypothetical protein  97.79 
 
 
181 aa  359  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1449  hypothetical protein  92.22 
 
 
180 aa  335  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1105  hypothetical protein  58.99 
 
 
200 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1110  hypothetical protein  58.43 
 
 
200 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0370996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1264  hypothetical protein  58.43 
 
 
200 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0898  ATPase-like protein  58.52 
 
 
198 aa  204  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0117195 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3011  hypothetical protein  57.87 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1563  hypothetical protein  57.87 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.91251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3033  hypothetical protein  57.87 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0965  hypothetical protein  57.87 
 
 
200 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0901  hypothetical protein  57.47 
 
 
197 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1249  ATPase-like protein  55.68 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0558  hypothetical protein  56.25 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2437  ATPase-like protein  59.43 
 
 
193 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1780  ATPase-like  59.43 
 
 
197 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2392  ATPase-like protein  59.43 
 
 
197 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2397  ATPase-like protein  58.86 
 
 
197 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0627057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2301  ATPase-like protein  58.29 
 
 
193 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4407  ATPase-like protein  57.71 
 
 
184 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0956  ATPase  50.58 
 
 
183 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3190  hypothetical protein  52.94 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5718  ATPase-like  55.43 
 
 
194 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1753  hypothetical protein  52.33 
 
 
185 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0969564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6251  ATPase-like protein  51.74 
 
 
181 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174266  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4592  hypothetical protein  52.87 
 
 
184 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83562  normal  0.186413 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1221  hypothetical protein  41.24 
 
 
187 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3245  hypothetical protein  45.29 
 
 
183 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.865023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3088  hypothetical protein  51.46 
 
 
175 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1215  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4350  hypothetical protein  44.12 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1895  hypothetical protein  39.33 
 
 
184 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305871  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1658  ATPase  40.68 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1493  hypothetical protein  32.4 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.33943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0089  ATPase  38.73 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0313  hypothetical protein  37.14 
 
 
191 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0601168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0136  ATPase-like protein  32.39 
 
 
184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0328  hypothetical protein  38.37 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1934  hypothetical protein  36.78 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1780  hypothetical protein  36.78 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0253  hypothetical protein  36.42 
 
 
177 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.108474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0575  hypothetical protein  36.93 
 
 
209 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0519809  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2102  hypothetical protein  36.93 
 
 
177 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.036831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2343  hypothetical protein  37.14 
 
 
181 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.658605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3501  hypothetical protein  35.43 
 
 
177 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09608  hypothetical protein  30.29 
 
 
189 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0525  ATPase-like protein  37.71 
 
 
183 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00591  ATPase  35.84 
 
 
196 aa  97.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2315  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001902  predicted ATPase  35.47 
 
 
180 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1324  hypothetical protein  31.25 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3426  ATPase-like  35.39 
 
 
209 aa  85.1  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330082  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2590  hypothetical protein  31.49 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2717  hypothetical protein  30.94 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2691  hypothetical protein  31.28 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5385  hypothetical protein  31.02 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593333  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000254  hypothetical protein  32.14 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2406  hypothetical protein  26.7 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.943872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1062  hypothetical protein  29.61 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0072  hypothetical protein  25.53 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>