23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2776 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  40.12 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  45.16 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  37.61 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  40.66 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0325  hypothetical protein  52.42 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  51.46 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  40 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  40.21 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  43.59 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  36.07 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  40.11 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  42.72 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  50.79 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  35.58 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  36.07 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  37.39 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  33.33 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  42.57 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  43.06 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>