13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1002 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  100 
 
 		 465 aa  890    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.604379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  46.45 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  35.7 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  37.07 
 
 		 419 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  39.65 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  26.44 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  31.53 
 
 		 714 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  33.14 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  46.94 
 
 		 354 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  27.59 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  28.95 
 
 		 636 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  35.56 
 
 		 634 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  27.4 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>