17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0171 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0171  putative RNA methylase  100 
 
 
442 aa  826    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  38.13 
 
 
357 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  40 
 
 
349 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  37.94 
 
 
350 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  37.23 
 
 
352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  34.41 
 
 
360 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  41.51 
 
 
339 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  26.7 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  32.08 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  30.26 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  28.98 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  30.53 
 
 
333 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  29.77 
 
 
334 aa  47  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  30.23 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  30.53 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  29.01 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  40.23 
 
 
200 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>