42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  100 
 
 
963 aa  1934    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  83.87 
 
 
1402 aa  645    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  34.73 
 
 
883 aa  329  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  35.38 
 
 
1562 aa  322  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.55 
 
 
1019 aa  316  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  30.25 
 
 
2268 aa  157  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.34 
 
 
1064 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  27.37 
 
 
607 aa  129  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  33.1 
 
 
2281 aa  128  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24300  hypothetical protein  31.71 
 
 
362 aa  83.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.58 
 
 
2122 aa  79  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.4 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 
1888 aa  62.4  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  33.64 
 
 
982 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1056  collagen adhesin domain protein  33.64 
 
 
683 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  49.23 
 
 
1207 aa  53.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  25.79 
 
 
2272 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 
969 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.14 
 
 
971 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 
969 aa  52.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  23.66 
 
 
2136 aa  50.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  42.86 
 
 
1093 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  26.11 
 
 
3393 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  42.86 
 
 
1093 aa  49.7  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  26.91 
 
 
1804 aa  49.3  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.13 
 
 
1112 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.11 
 
 
3486 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  26.11 
 
 
1102 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  24.22 
 
 
2179 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  43.66 
 
 
480 aa  47.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  31.25 
 
 
928 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  28.75 
 
 
771 aa  47  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.18 
 
 
1328 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  36.92 
 
 
853 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  28.06 
 
 
1307 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.33 
 
 
3210 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  41.27 
 
 
1055 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.33 
 
 
3190 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  25.66 
 
 
3333 aa  45.8  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.89 
 
 
3392 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  25.89 
 
 
3242 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  36.23 
 
 
4909 aa  44.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>