36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0742 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0742  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  755    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  32.27 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  25.53 
 
 
451 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4136  hypothetical protein  21.33 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0594523  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07250  capsular associated protein, putative  26.13 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00730  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 
604 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236908  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04980  capsular associated protein  22.46 
 
 
522 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.964514  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01440  CAP64 gene product - related  22.05 
 
 
507 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06800  CAP64 gene product - related  22.41 
 
 
481 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.129415  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01140  expressed protein  22.79 
 
 
551 aa  53.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3517  putative O-antigen related protein  25.34 
 
 
645 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0419564  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  33.67 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.96 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  33.71 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.78 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.78 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.78 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.78 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.78 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  32.14 
 
 
200 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  26.04 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  27.43 
 
 
201 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  25.95 
 
 
204 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  23.33 
 
 
182 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  32.41 
 
 
201 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  23.71 
 
 
208 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  26.56 
 
 
226 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  19.69 
 
 
196 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  24.47 
 
 
238 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  22.4 
 
 
207 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  22.4 
 
 
207 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  22.4 
 
 
207 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
252 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  22.4 
 
 
208 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  21.47 
 
 
207 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  22.4 
 
 
208 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>