22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0502 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  761    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0002375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1340  hypothetical protein  29.75 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3191  chromosome partitioning ATPase  26.03 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.984845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  21.36 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  18.77 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  18.79 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.26 
 
 		 537 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  20.48 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  20.99 
 
 		 263 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  20.44 
 
 		 412 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  22.37 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.45 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  19.21 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.72 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.42 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  24.4 
 
 		 238 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.49 
 
 		 276 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>