More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4914 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  59.77 
 
 
690 aa  809    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  61.83 
 
 
679 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  55.52 
 
 
682 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  58.47 
 
 
680 aa  793    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  60.83 
 
 
678 aa  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  54.22 
 
 
714 aa  745    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  57.43 
 
 
704 aa  791    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  60.65 
 
 
684 aa  815    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.29 
 
 
686 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  55.31 
 
 
802 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  57.46 
 
 
680 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  62.57 
 
 
679 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  54.22 
 
 
678 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  59.91 
 
 
690 aa  807    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  60.89 
 
 
691 aa  809    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  100 
 
 
683 aa  1387    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  54.44 
 
 
716 aa  740    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  61.5 
 
 
682 aa  806    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  60.65 
 
 
690 aa  816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  57.46 
 
 
680 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  61.32 
 
 
681 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  60.82 
 
 
679 aa  842    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  61.34 
 
 
680 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  61.23 
 
 
686 aa  807    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  54.51 
 
 
689 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  54.51 
 
 
685 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  60.65 
 
 
699 aa  799    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  59.12 
 
 
681 aa  819    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  62.92 
 
 
687 aa  851    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  57.46 
 
 
680 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  59.35 
 
 
680 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  58.87 
 
 
692 aa  828    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  58.79 
 
 
738 aa  788    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  44.99 
 
 
645 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  44.83 
 
 
642 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  46.26 
 
 
652 aa  558  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  43.71 
 
 
647 aa  536  1e-151  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  42.45 
 
 
635 aa  535  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.3 
 
 
635 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.66 
 
 
647 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  43.64 
 
 
676 aa  498  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  63.19 
 
 
846 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  42.3 
 
 
644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.02 
 
 
650 aa  306  7e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  32.39 
 
 
600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.84 
 
 
554 aa  184  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.46 
 
 
587 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.06 
 
 
566 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  25.85 
 
 
583 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.41 
 
 
566 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.12 
 
 
576 aa  171  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.12 
 
 
576 aa  171  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.93 
 
 
566 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  28.22 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  24.11 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.87 
 
 
598 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  30.82 
 
 
539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  27.29 
 
 
559 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  30 
 
 
541 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.94 
 
 
552 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.91 
 
 
577 aa  151  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  26.99 
 
 
556 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
575 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.24 
 
 
543 aa  150  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.46 
 
 
658 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.18 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.13 
 
 
626 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.22 
 
 
564 aa  148  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.8 
 
 
562 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.82 
 
 
543 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  27.44 
 
 
556 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  28.5 
 
 
586 aa  145  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.08 
 
 
535 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.87 
 
 
567 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  27.47 
 
 
540 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.69 
 
 
574 aa  144  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.86 
 
 
571 aa  143  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  28.64 
 
 
574 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27.29 
 
 
554 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  28.35 
 
 
576 aa  142  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  25.96 
 
 
552 aa  141  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  26.28 
 
 
561 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  27.73 
 
 
550 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.11 
 
 
561 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  26.98 
 
 
554 aa  140  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  24.65 
 
 
686 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.11 
 
 
561 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  25.94 
 
 
565 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.6 
 
 
548 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  25 
 
 
545 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.3 
 
 
567 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.12 
 
 
538 aa  138  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  25.16 
 
 
546 aa  138  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  27.26 
 
 
567 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  25.92 
 
 
566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  27.33 
 
 
591 aa  137  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.17 
 
 
597 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  28.68 
 
 
545 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  30.52 
 
 
549 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  30.52 
 
 
549 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>