20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1041 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  78.12 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  82.29 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  61.46 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  59.38 
 
 		 96 aa  117  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  55.21 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  52.08 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  32.63 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  39.36 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  28.42 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  27.66 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  30.53 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3159  hypothetical protein  28.26 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.848333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2756  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0253096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>