299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0044 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 72 bp  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  98.21 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  98.21 
 
 		 76 bp  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0030  tRNA-Gly  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0064  tRNA-Gly  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173961  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0038  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0024  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  95.92 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0028  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0027  tRNA-Gly  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>