20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7027 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7027  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 447 aa  889    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8723  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 		 770 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196332  normal  0.0764847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.07 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.49 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.86 
 
 		 1454 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.63 
 
 		 1241 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.18 
 
 		 557 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.85 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25.44 
 
 		 901 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.27 
 
 		 1328 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 795 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.97 
 
 		 1009 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  32.94 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  25.54 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>