28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5414 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  856    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  56.27 
 
 
307 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  56.47 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  49.44 
 
 
290 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  51.35 
 
 
286 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  48.24 
 
 
276 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  56.61 
 
 
236 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  51.31 
 
 
317 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  51.36 
 
 
304 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  46.18 
 
 
306 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  43.99 
 
 
308 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  44.82 
 
 
288 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  45.91 
 
 
269 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  41.78 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  44.98 
 
 
283 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  49.07 
 
 
288 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  49.05 
 
 
288 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  35.42 
 
 
278 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  29.73 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  35.9 
 
 
289 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  30.2 
 
 
273 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  35.94 
 
 
274 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  30.57 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  38.54 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  28.38 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  32.16 
 
 
250 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  34.42 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>