27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4380 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4380  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 557 aa  1109    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.658401  normal  0.278802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8634  major facilitator superfamily MFS_1  51.94 
 
 		 706 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00926196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.672028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 395 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0804  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1693  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0151709  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  27.73 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2503  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  22.95 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2406  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106642  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.4 
 
 		 472 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 472 aa  47  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  20.47 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 439 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1613  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  0.254519 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54022  probable hexose transporter  26.38 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  23.45 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.91 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  24.28 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 439 aa  43.9  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.72 
 
 		 445 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>