21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  33.04 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  35.11 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  34.95 
 
 		 241 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  38.24 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  32.14 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  35.92 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  34.44 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  33 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  40 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  31.73 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  34.29 
 
 		 255 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  32.22 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  32.22 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  29.82 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  32.04 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  34.44 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  34.44 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  34.44 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  36.26 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  32.22 
 
 		 256 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>