26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  100 
 
 		 250 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  30.2 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  30.1 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  30.2 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  30.52 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  29.92 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  29.92 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  33.47 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  28.05 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  30.92 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  30.21 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  24.57 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  29.18 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  27.1 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  29.18 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  29.18 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  31.58 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  31.58 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  24.89 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7091  hypothetical protein  24.22 
 
 		 547 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>