24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1009 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  76.19 
 
 		 254 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  76.35 
 
 		 243 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  73.41 
 
 		 254 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  66.53 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  64.88 
 
 		 258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  65.71 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  62.81 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  59.59 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  45.42 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  45.42 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  43.5 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  30.2 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  26.01 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  24.02 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  30.06 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  29.37 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  29.37 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  29.37 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  31.34 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1389  hypothetical protein  19.72 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0530  hypothetical protein  19.72 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  28.37 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>