16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3772 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  75.38 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  45.42 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  42.39 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  42.39 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  42.26 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  42.62 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  45.08 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  42.19 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  42.55 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  38.46 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  24.66 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  31.58 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  24.41 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>