19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1223 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  63.81 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  64 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  62.4 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  61.85 
 
 
254 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  62.96 
 
 
243 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  60.69 
 
 
258 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  62.35 
 
 
254 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  59.59 
 
 
254 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  38.46 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  38.37 
 
 
261 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  26.75 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  28.4 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  25.58 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  27.57 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  25.24 
 
 
219 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  27.49 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>