15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3616 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  58.93 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  55.41 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  54.95 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  54.95 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  56.7 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  56.5 
 
 		 234 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  38.22 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  24.89 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  30.87 
 
 		 253 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  28.37 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  27.92 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  27.92 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>