20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2409 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  55.75 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4587  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  41.74 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.47 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  36.11 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.28 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.28 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.28 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  32.31 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.21 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  33.33 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  29.51 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  28.93 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  30.16 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  32 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1755  hypothetical protein  27.68 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3381  hypothetical protein  28.07 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>