19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  52.28 
 
 
247 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  43.98 
 
 
253 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  38.38 
 
 
278 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  43.88 
 
 
257 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  38.75 
 
 
274 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  36.67 
 
 
274 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  34.67 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  38.75 
 
 
252 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  33.48 
 
 
251 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  36.63 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  36.84 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  29.1 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  27.93 
 
 
285 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  28.52 
 
 
285 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  27.21 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  26.61 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>