37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1070 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  100 
 
 
330 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1451  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1532  hypothetical protein  43.81 
 
 
125 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  29.52 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3703  AIG2 family protein  49.52 
 
 
117 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
220 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  30.56 
 
 
588 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  33.52 
 
 
228 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5145  hypothetical protein  48.11 
 
 
117 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
562 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
599 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6923  hypothetical protein  44.04 
 
 
124 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5297  AIG2 family protein  49.06 
 
 
117 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  33.9 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  32.77 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  28.7 
 
 
223 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4897  hypothetical protein  41.18 
 
 
106 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1655  AIG2 family protein  44.23 
 
 
112 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1012  AIG2 family protein  43.81 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0662601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.61 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  28.46 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  46.67 
 
 
96 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  72.73 
 
 
98 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  30 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  28.34 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  32.8 
 
 
354 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  28.48 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  33.12 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.06 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  31.11 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  26.89 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  26.11 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  27.75 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  32.85 
 
 
347 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12555  cytoplasmic peptidase pepQ  33.33 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.478441  normal  0.0221241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  29.25 
 
 
371 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  33.33 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>