13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5297 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5297  AIG2 family protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5145  hypothetical protein  92.31 
 
 		 117 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3703  AIG2 family protein  61.47 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1451  hypothetical protein  51.75 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1532  hypothetical protein  51.75 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6923  hypothetical protein  53.04 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1012  AIG2 family protein  50 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0662601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1655  AIG2 family protein  47.12 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4897  hypothetical protein  39.05 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  56.94 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  49.06 
 
 		 330 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  59.38 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  30.17 
 
 		 365 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>