12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1012 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1012  AIG2 family protein  100 
 
 
120 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0662601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1451  hypothetical protein  45.79 
 
 
125 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1532  hypothetical protein  45.79 
 
 
125 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1655  AIG2 family protein  57.55 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3703  AIG2 family protein  53.77 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5145  hypothetical protein  50.48 
 
 
117 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5297  AIG2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6923  hypothetical protein  54.21 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4897  hypothetical protein  35.85 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  43.81 
 
 
330 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  53.42 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  62.86 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>