22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0487 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1082  hypothetical protein  55.86 
 
 
1443 aa  1267    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071648  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0487  hypothetical protein  100 
 
 
1406 aa  2726    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0538  hypothetical protein  36.11 
 
 
1367 aa  672    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1491  hypothetical protein  44.94 
 
 
1366 aa  877    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332853  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03694  hypothetical protein  41.44 
 
 
1376 aa  799    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  46.72 
 
 
1411 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2802  hypothetical protein  33.04 
 
 
1404 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0291891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2871  hypothetical protein  32.97 
 
 
1404 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0168  hypothetical protein  32.11 
 
 
1409 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3861  hypothetical protein  44.27 
 
 
1347 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2669  hypothetical protein  31.68 
 
 
1448 aa  196  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  23.54 
 
 
1388 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.19 
 
 
1350 aa  180  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5500  hypothetical protein  37.72 
 
 
1425 aa  175  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.0122145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1180  SMC domain protein  34.11 
 
 
1353 aa  162  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0382  hypothetical protein  34.14 
 
 
1404 aa  158  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2612  hypothetical protein  28.54 
 
 
1427 aa  157  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251677  normal  0.0907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0302  ATPase  35.19 
 
 
1376 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2035  chromosome segregation ATPase-like protein  22.52 
 
 
1370 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0631  SMC domain protein  36.29 
 
 
1365 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0869  hypothetical protein  35.05 
 
 
1354 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0673993  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5099  hypothetical protein  35.39 
 
 
1584 aa  87  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.962428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>