48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0349 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  39.3 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  36.5 
 
 
284 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  36.88 
 
 
284 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  36.5 
 
 
267 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  36.12 
 
 
285 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  36.5 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  33.83 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  37.31 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  35.59 
 
 
320 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  33.21 
 
 
324 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  35.61 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  33.46 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  32.84 
 
 
313 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
296 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  33.2 
 
 
261 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  34.25 
 
 
300 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  32.85 
 
 
309 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  98.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  30.57 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  31.85 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  32.84 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  30.99 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  30.34 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  32.45 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  29.45 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  30.77 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  29.75 
 
 
307 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  35.63 
 
 
198 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  31.5 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  31.5 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  31.09 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  33.1 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  34.46 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  32.05 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  34.67 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  34.59 
 
 
181 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  33.11 
 
 
180 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  30.66 
 
 
201 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  32.68 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  31.79 
 
 
192 aa  55.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  28.48 
 
 
209 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  31.21 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  30.63 
 
 
197 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  37.33 
 
 
216 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  24.36 
 
 
199 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  48.78 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  29.41 
 
 
205 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>