More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3845 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  63.2 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  60.48 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  61.6 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  62.4 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  62.4 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  56.69 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  55.47 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 129 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2728  glycine cleavage system protein H  65.52 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0694731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  54.69 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  51.64 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  54.26 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  50 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  49.18 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  52.34 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  48.03 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1560  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  48.18 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.57 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  45.9 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  53.85 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  46.72 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>