72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3057 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  100 
 
 		 171 aa  361  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 		 190 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.29 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.29 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.38 
 
 		 166 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  46.11 
 
 		 199 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.91 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.76 
 
 		 334 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.28 
 
 		 326 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.82 
 
 		 190 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.71 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 		 336 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.61 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.06 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.79 
 
 		 545 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1946  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  29.41 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  29.41 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  29.41 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.66 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  32.89 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2256  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  27.92 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  28.48 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.63 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.019887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  24.83 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4217  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4031  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.45 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0346111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.5 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.65 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  27.7 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  33.77 
 
 		 128 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  25 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0635  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.354638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.75 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.16 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.76 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.62 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  31.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.83 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  25.66 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  28.67 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  32.1 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.5 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  32.1 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0909  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 		 135 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0137  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  31.71 
 
 		 128 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  24.66 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  27.1 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.39 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1846  glyoxalase family protein  25.74 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  30.49 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.92 
 
 		 127 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  23.27 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>