19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3023 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3418  hypothetical protein  49.11 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  45.18 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  44.34 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  35 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3018  hypothetical protein  30.72 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02487  hypothetical protein  22.4 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4155  hypothetical protein  30.19 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  26.21 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  29.49 
 
 		 446 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  29.49 
 
 		 445 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  30 
 
 		 537 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  30 
 
 		 537 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  29.67 
 
 		 576 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  22.52 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  26.85 
 
 		 537 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8810  hypothetical protein  25.25 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  36.84 
 
 		 481 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  24.69 
 
 		 224 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>