15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2232 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2232  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2080  amino acid ABC transporter  35.22 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  32.92 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  32.08 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2549  amino acid ABC transporter  30.25 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  25.41 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.48 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  23.67 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  24.39 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  24.39 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  24.39 
 
 		 281 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.13 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  24.34 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  23.94 
 
 		 481 aa  43.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  24.03 
 
 		 249 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>