111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1861 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  98.77 
 
 
326 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  100 
 
 
326 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.51 
 
 
325 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.49 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.44 
 
 
322 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.38 
 
 
322 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.65 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.23 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.18 
 
 
300 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.03 
 
 
377 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.45 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  29.9 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.52 
 
 
299 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  29.57 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.54 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  29.33 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  30.97 
 
 
303 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  30.97 
 
 
303 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.5 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  27 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  26.73 
 
 
299 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.84 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.84 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5366  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.6 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.374079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.62 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  29.66 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.52 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.39 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  28 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3942  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.64 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.09 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3614  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480053  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.89 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.95 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  24.46 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.52 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  21.97 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.54 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.47 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  25.32 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.94 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  26.33 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.32 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.79 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.2 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.96 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  25.33 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.33 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  24.73 
 
 
297 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0369  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.93 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  23.44 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  23.94 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.4 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  22.04 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.22 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.26 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1857  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.36 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.703313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2740  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.94 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.52 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  27.06 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.25 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.2 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  29.52 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0555  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.08 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.83 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2598  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.11 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  20.92 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  22.68 
 
 
293 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3452  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.3 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.95 
 
 
332 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4023  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.74 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  24.56 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  20.22 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2322  N-acetylglucosamine kinase  28.85 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.24 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25330  predicted N-acetylglucosamine kinase  21.36 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261612  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0278  hypothetical protein  23.32 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.780872  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2582  glucosamine kinase  25.27 
 
 
291 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  27.92 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.39 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0974  hypothetical protein  24.71 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.131863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.57 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.57 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5824  hypothetical protein  22.95 
 
 
322 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2621  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  21.61 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.248705  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5376  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.2 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.320248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.07 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.81 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.86 
 
 
305 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11050  hypothetical protein  26.36 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.505129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  25.16 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2513  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.78 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.88 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.88 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.1 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.88 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.18 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>