72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0278 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0278  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.780872  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2066  hypothetical protein  57.14 
 
 
312 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24411  N-acetylglucosamine kinase  52.73 
 
 
320 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.61 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.47 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.57 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.77 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.42 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.43 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  23.51 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  23.51 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.31 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.56 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  25.25 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  25.25 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0292  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.36 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.353366  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.32 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.34 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  23.66 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.48 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  23.66 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.06 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  23.34 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.55 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0319  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.85 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414732  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.59 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.09 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  23.91 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.76 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1852  N-acetylglucosamine kinase  25.7 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000190255  hitchhiker  0.000260194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.74 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  24.27 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.03 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.62 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3136  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.16 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235099  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.32 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.62 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  23.42 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.99 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  28.06 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.71 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.03 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.35 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.05 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1857  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.703313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.27 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5366  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.28 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.374079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.32 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.81 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.02 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.79 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  23.32 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2621  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.74 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.248705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.64 
 
 
300 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0369  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.55 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  29.19 
 
 
318 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3151  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000102812  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.71 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.6 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1653  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.63 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0892044  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.18 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  30.71 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  30.71 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.75 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.92 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4217  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.57 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0191296 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2130  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.41 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>