35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1623 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  97.6 
 
 		 333 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0365  phosphotransferase domain-containing protein  28.7 
 
 		 776 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0985561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  31.56 
 
 		 546 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  29.18 
 
 		 742 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  27.98 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.94 
 
 		 1949 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  25.07 
 
 		 1710 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.12 
 
 		 2254 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  23.3 
 
 		 1855 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2748  hypothetical protein  22.35 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  24.74 
 
 		 486 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  20.71 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  26.51 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  32.22 
 
 		 570 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24 
 
 		 574 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  35.8 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  35.8 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  35.8 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  35.8 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  26.27 
 
 		 572 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  20.59 
 
 		 460 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  25.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  20.82 
 
 		 458 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  34.74 
 
 		 578 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  34.74 
 
 		 594 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  50 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>