38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1904 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0584132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1623  hypothetical protein  97.6 
 
 		 333 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000284938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0365  phosphotransferase domain-containing protein  29.61 
 
 		 776 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0985561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0337  phosphotransferase domain-containing protein  30.85 
 
 		 546 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0319  phosphotransferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 546 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.888377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0025  phosphotransferase domain-containing protein  30.4 
 
 		 742 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.04569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1554  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.832724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1155  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.62 
 
 		 1949 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.52 
 
 		 2254 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  25.36 
 
 		 1710 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  23.62 
 
 		 1855 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2748  hypothetical protein  22.35 
 
 		 429 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  23.48 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  26.91 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  20.57 
 
 		 497 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24 
 
 		 574 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  32.94 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  32.22 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  32.94 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  32.94 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  32.94 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3335  phosphotransferase domain-containing protein  25.91 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  21.89 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  32.94 
 
 		 572 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  26.99 
 
 		 572 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  50 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  23.02 
 
 		 574 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  20.86 
 
 		 452 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3024  phosphotransferase domain-containing protein  23.46 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.951388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  20.29 
 
 		 460 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09811  metal-dependent phosphoesterase  39.29 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0708  hypothetical protein  23.84 
 
 		 646 aa  42.7  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>