21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1006 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  49.62 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  31.64 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  30.2 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  29.8 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  30.86 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  29.8 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  29.41 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  27.41 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  28.5 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  21.05 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>