13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00760 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  249  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02130  conserved hypothetical protein  42.99 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380886  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  38.14 
 
 
359 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  35.11 
 
 
238 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  38 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  38.1 
 
 
254 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02040  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 
499 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  35.05 
 
 
237 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 
317 aa  51.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
273 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  31.37 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  33.68 
 
 
293 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  26.32 
 
 
351 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>