17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0023 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0023  cpp26  100 
 
 		 597 aa  1196    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.85156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26.88 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  29.23 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  25.65 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 460 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  25.67 
 
 		 621 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  24.19 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  26.14 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  26.18 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  29.8 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  20.98 
 
 		 443 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  23.68 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  23.81 
 
 		 495 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  24.47 
 
 		 454 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  26.9 
 
 		 473 aa  43.9  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  24.68 
 
 		 446 aa  43.9  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>