More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2417 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  100 
 
 
626 aa  1302    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  47.22 
 
 
700 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  46.6 
 
 
686 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  45.74 
 
 
658 aa  585  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  45.92 
 
 
688 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33475  predicted protein  28.59 
 
 
699 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0672097  normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40885  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.66 
 
 
713 aa  240  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45509  predicted protein  26.78 
 
 
723 aa  214  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.25219  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02550  NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  25.97 
 
 
652 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  27.08 
 
 
538 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.98 
 
 
574 aa  184  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  26.96 
 
 
567 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  25.86 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.66 
 
 
542 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.66 
 
 
542 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  25.99 
 
 
652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.62 
 
 
575 aa  175  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
545 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  24.54 
 
 
647 aa  172  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  26.97 
 
 
561 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  25.88 
 
 
647 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  26.97 
 
 
561 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.04 
 
 
577 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  26.92 
 
 
539 aa  171  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.48 
 
 
548 aa  171  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08203  glutamine dependent NAD synthetase (Eurofung)  25.45 
 
 
678 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0452691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  26.38 
 
 
539 aa  167  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  28.53 
 
 
538 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.73 
 
 
559 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.67 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.41 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.41 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  26.26 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  25.47 
 
 
573 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.7 
 
 
583 aa  165  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  25.6 
 
 
546 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  26.46 
 
 
635 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  26.46 
 
 
635 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  27.64 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  25.43 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  26.59 
 
 
574 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  26.96 
 
 
554 aa  163  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  25.92 
 
 
544 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  26.09 
 
 
561 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.69 
 
 
566 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  27.39 
 
 
536 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  27.43 
 
 
583 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.31 
 
 
561 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  25.6 
 
 
567 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  27.11 
 
 
573 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  26.58 
 
 
556 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.49 
 
 
564 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  27.39 
 
 
536 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.1 
 
 
566 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.29 
 
 
566 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  27.05 
 
 
552 aa  158  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  24.43 
 
 
642 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  26.85 
 
 
556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.51 
 
 
540 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  25.2 
 
 
560 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  26.51 
 
 
540 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  26.51 
 
 
540 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  26.6 
 
 
550 aa  157  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  26.6 
 
 
562 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  25.36 
 
 
540 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  26.07 
 
 
543 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  25.79 
 
 
540 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  27.11 
 
 
587 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.97 
 
 
543 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27.63 
 
 
562 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  25.57 
 
 
576 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  27 
 
 
552 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
554 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.57 
 
 
539 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  26.09 
 
 
566 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  26.59 
 
 
576 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  24.14 
 
 
566 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  25.68 
 
 
559 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  27.14 
 
 
552 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  26.16 
 
 
559 aa  151  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  25.97 
 
 
554 aa  151  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  26.25 
 
 
547 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  26.85 
 
 
545 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  25.08 
 
 
571 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  24.39 
 
 
542 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.66 
 
 
577 aa  150  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  26.79 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.46 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  24.48 
 
 
560 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  25.68 
 
 
585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.09 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  26.72 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  26.8 
 
 
571 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  26.37 
 
 
609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  25.47 
 
 
585 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  26.37 
 
 
609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  26.37 
 
 
566 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  26.37 
 
 
566 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.03 
 
 
591 aa  148  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  26.48 
 
 
545 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>