16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1779 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  100 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  50 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  47.79 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  52.52 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  41.48 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  38.69 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  39.71 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  39.71 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  38.52 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  24.83 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1114  hypothetical protein  27.4 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000160939  normal  0.117206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4124  hypothetical protein  27.4 
 
 		 151 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000146731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  30.23 
 
 		 247 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>