18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05325 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05325  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  228  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.285805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0717  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  41.07 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3450  hypothetical protein  40.57 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  35.4 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  30.7 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  35.48 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  35.14 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  31.37 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  32.46 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  27.55 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  30.91 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  35.4 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2689  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  31 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  32.04 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  36.11 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>