34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4468 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  286  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  45.65 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  44.6 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  41.55 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  44.07 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  44.07 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  43.22 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  41.53 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  41.53 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  41.53 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  42.37 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  42.74 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  42.74 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  42.74 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  42.74 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  42.74 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  42.74 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  42.74 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  41.18 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  41.53 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  41.53 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  41.53 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  40.54 
 
 
138 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  39.19 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  34.67 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  35.53 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  33.78 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  26.19 
 
 
235 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.49 
 
 
518 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  29.11 
 
 
243 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  39.02 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  36.76 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>