45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0771 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  67.52 
 
 
122 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  49.52 
 
 
120 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  48.6 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  44.23 
 
 
105 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  42.06 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  40.38 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  36.79 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  36.79 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  40.78 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  45.87 
 
 
123 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  43.27 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  36.89 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  36.54 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  36.54 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  40.78 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  36.19 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  33.01 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  33.01 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  33.01 
 
 
273 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  32.04 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  32.04 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  32.04 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  36.54 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  36.54 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  34.62 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  31.07 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  31.07 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  31.07 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  31.07 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  29.91 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  31.07 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  39.39 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  30.38 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  35.14 
 
 
138 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  27.5 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  29.9 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  25.93 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  25.47 
 
 
112 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>