109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0011 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0011  phenylalanine 4-monooxygenase  100 
 
 
336 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3921  phenylalanine 4-monooxygenase  93.24 
 
 
296 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169368  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  75.08 
 
 
324 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2977  phenylalanine 4-monooxygenase  73.97 
 
 
320 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0078  phenylalanine 4-monooxygenase  73.97 
 
 
320 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3259  phenylalanine 4-monooxygenase  76.57 
 
 
306 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0096  phenylalanine 4-monooxygenase  73.65 
 
 
320 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3337  phenylalanine 4-monooxygenase  76.35 
 
 
297 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0069  phenylalanine 4-monooxygenase  76.79 
 
 
308 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0077  phenylalanine 4-monooxygenase  75.17 
 
 
308 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2927  phenylalanine 4-monooxygenase  72.62 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0206  phenylalanine 4-monooxygenase  72.32 
 
 
336 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3383  phenylalanine 4-monooxygenase  77.7 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1616  phenylalanine 4-monooxygenase  77.7 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4001  phenylalanine 4-monooxygenase  77.7 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4075  phenylalanine 4-monooxygenase  77.7 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  77.7 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3533  phenylalanine 4-monooxygenase  65.76 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3549  phenylalanine 4-monooxygenase  67.01 
 
 
314 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3225  phenylalanine 4-monooxygenase  66.67 
 
 
314 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3387  phenylalanine 4-monooxygenase  64.07 
 
 
316 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3355  phenylalanine 4-monooxygenase  66.33 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03285  phenylalanine 4-monooxygenase  61.09 
 
 
296 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0032  phenylalanine 4-monooxygenase  60.58 
 
 
297 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686174  hitchhiker  0.000000292031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1117  phenylalanine 4-monooxygenase  54.21 
 
 
299 aa  315  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0553  phenylalanine 4-monooxygenase  57.62 
 
 
289 aa  315  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0201466  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2046  phenylalanine 4-monooxygenase  56.72 
 
 
303 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0168  phenylalanine 4-monooxygenase  53.48 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4215  phenylalanine 4-monooxygenase  54.78 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2208  phenylalanine 4-monooxygenase  55.43 
 
 
293 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0291015  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0347  phenylalanine 4-monooxygenase  54.34 
 
 
295 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.72687  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1853  phenylalanine 4-monooxygenase  49.82 
 
 
293 aa  292  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.56833  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4193  phenylalanine 4-monooxygenase  55.12 
 
 
292 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4768  phenylalanine 4-monooxygenase  53.03 
 
 
292 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1267  phenylalanine 4-monooxygenase  52.55 
 
 
296 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0518  phenylalanine 4-monooxygenase  52.57 
 
 
279 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261474  normal  0.0225158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0534  phenylalanine 4-monooxygenase  52.57 
 
 
279 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2136  phenylalanine 4-monooxygenase  52.76 
 
 
275 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3187  phenylalanine 4-monooxygenase  46.49 
 
 
312 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34650  phenylalanine 4-monooxygenase  50.61 
 
 
261 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1392  phenylalanine 4-monooxygenase  45.72 
 
 
290 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00177331  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3575  phenylalanine 4-monooxygenase  49.57 
 
 
265 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.861489  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2868  phenylalanine 4-monooxygenase  50.22 
 
 
266 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.127384  hitchhiker  0.00000000657898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3995  phenylalanine 4-monooxygenase  48.89 
 
 
262 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.022764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1822  phenylalanine-4-hydroxylase  48.26 
 
 
265 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1484  phenylalanine 4-monooxygenase  49.33 
 
 
266 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3779  phenylalanine 4-monooxygenase  49.33 
 
 
262 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.736945  hitchhiker  0.000564604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4490  phenylalanine 4-monooxygenase  47.84 
 
 
262 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1424  phenylalanine 4-monooxygenase  47.84 
 
 
262 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.17475  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1499  phenylalanine 4-monooxygenase  46.34 
 
 
263 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4644  phenylalanine 4-monooxygenase  47.83 
 
 
262 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0943506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1515  phenylalanine 4-monooxygenase  48.89 
 
 
266 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.0509448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1386  phenylalanine 4-monooxygenase  46.98 
 
 
266 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1479  phenylalanine 4-monooxygenase  48.89 
 
 
266 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00165171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2607  phenylalanine 4-monooxygenase  47.41 
 
 
271 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109404  hitchhiker  0.000000531063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52990  phenylalanine 4-monooxygenase  46.96 
 
 
262 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3112  phenylalanine 4-monooxygenase  46.96 
 
 
261 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.417382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2674  phenylalanine 4-monooxygenase  47.41 
 
 
271 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.192739  hitchhiker  0.000490875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2781  phenylalanine 4-monooxygenase  47.41 
 
 
271 aa  225  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.596236  hitchhiker  0.0000732891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1666  phenylalanine 4-monooxygenase  46.98 
 
 
271 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6319  phenylalanine-4-hydroxylase  46.98 
 
 
261 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803918  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1328  phenylalanine 4-monooxygenase  43.73 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2999  phenylalanine 4-monooxygenase  46.88 
 
 
266 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.25361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1435  phenylalanine 4-monooxygenase  48.23 
 
 
277 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0156707  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2595  phenylalanine 4-monooxygenase  45.26 
 
 
263 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1448  phenylalanine 4-monooxygenase  46.22 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0546255  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0407  phenylalanine 4-monooxygenase  43.33 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2222  phenylalanine 4-monooxygenase  46.55 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05421  phenylalanine 4-monooxygenase  45.95 
 
 
264 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2108  aromatic amino acid hydroxylase  45.19 
 
 
244 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0346551  normal  0.391634 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001480  phenylalanine-4-hydroxylase  44.49 
 
 
264 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02830  phenylalanine 4-monooxygenase  43.81 
 
 
271 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0161825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3766  phenylalanine 4-monooxygenase  39 
 
 
267 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2700  phenylalanine 4-monooxygenase  40.95 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2572  phenylalanine 4-monooxygenase  40.95 
 
 
272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1715  phenylalanine 4-monooxygenase  45.25 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00750789  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1554  phenylalanine 4-monooxygenase  37.02 
 
 
291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.237867  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1041  phenylalanine 4-monooxygenase  41.22 
 
 
265 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2930  phenylalanine 4-monooxygenase  43.56 
 
 
265 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742608  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1076  phenylalanine 4-monooxygenase  39.83 
 
 
250 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0135613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1403  phenylalanine 4-monooxygenase  38.78 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1507  phenylalanine 4-monooxygenase  38.37 
 
 
263 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3025  phenylalanine 4-monooxygenase  35.46 
 
 
246 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0605  aromatic amino acid hydroxylase  35.87 
 
 
243 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3847  aromatic amino acid hydroxylase  34.67 
 
 
247 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3076  phenylalanine 4-monooxygenase  26.84 
 
 
585 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4439  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4489  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4477  phenylalanine 4-monooxygenase  26.76 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0759  phenylalanine 4-monooxygenase  26.71 
 
 
584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2753  phenylalanine 4-monooxygenase  29.79 
 
 
528 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5444  phenylalanine 4-monooxygenase  33.48 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.589228  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2895  phenylalanine 4-monooxygenase  30.66 
 
 
529 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0518578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3578  phenylalanine 4-monooxygenase  31.85 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4253  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4091  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4586  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4438  phenylalanine 4-monooxygenase  26.44 
 
 
584 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2986  phenylalanine 4-monooxygenase  30.66 
 
 
529 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2800  phenylalanine 4-monooxygenase  30.66 
 
 
529 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>